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深圳病毒多樣性測序分析要多久

發布時間: 2023-07-19 14:15:39

⑴ 細菌基因組測序完畢後進行基因組注釋需要耗時多久

做全基因組測序前,需要檢測dna濃度和純度宏基因組是指特定環境中全部生物(微生物)遺傳物質的總和。宏基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以獲得單個樣品的飽和數據量,可進行微生物群體的基因組成及功能注釋,微生物群體的物種分類,多樣性分析,群落結構分析,樣品間的物種或基因差異以及物種間的代謝網路研究,探索微生物與環境及宿主之間的關系,發掘和研究新的具有特定功能的基因等。與傳統方法相比,基於高通量測序的宏基因組研究無需構建克隆文庫,這避免了文庫構建過程中利用宿主菌對樣品進行克隆而引起的系統偏差,簡化了實驗操作,提高了測序效率。此外,宏基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養的限制,擴展了微生物資源的利用空間,為環境微生物群落的研究提供了有效工具。通過宏基因組深度測序可以揭示或估計環境中真實的物種多樣性和遺傳多樣性,挖掘具有應用價值的基因資源,應用於開發新的微生物活性物質,為研究和開發新的微生物活性物質提供有力支持。

⑵ 做一次病毒核酸檢測要經歷什麼過程需要多少費用

說到核酸檢測的費用,應該是許多人關心的問題。特別是前段時間有新聞報道說美國做一次新冠肺炎核酸檢測,扣了保險之外,個人還需要支付1600美元。看到這個新聞,無疑驚呆了許多小夥伴,核酸檢測真的那麼貴嗎?那麼在我們中國做一次新冠肺炎核酸檢測要多少錢呢?針對核酸檢測的問題,下面我們就一起來說說。





一、我國做一次核酸檢測需要多少費用?

★第三方檢測機構:全省新冠肺炎核酸定點檢測的第三方檢測機構開展新冠肺炎核酸檢測收費標准按不高於 160 元/人次執行(包括試劑、耗材等所有費用),鼓勵進一步降低檢測價格。

從湖南省的新冠肺炎核酸檢測價格標准來看,如果是在公立醫療機構檢測,雖然收費40元/人次,但是最終還是可以醫保報銷,從而實現個人免費。而如果是去第三方檢測,那麼最高的收費標准不高於160元/人次。

廣東省核酸檢測費用

廣東對於新冠肺炎核酸檢測費用所執行的標准就比湖南好多了。在2月28日,廣東省政府新聞辦舉行第34場疫情防控新聞發布會上,廣東將新冠肺炎篩查對象在發熱門診的核酸檢測、肺部CT檢查納入特殊醫療保障的范圍,實現新冠肺炎核酸檢測、CT篩查零收費。即使是在第三方檢測,比如廣州金域醫學檢驗中心、廣州達安臨床檢驗中心、廣州華銀醫學檢驗中心等,檢測費用也不需要患者承擔,全部由政府兜底。

而廣東的深圳也根據廣東省的執行標准,並出台了深圳市《關於加大力度做好新冠肺炎疫情醫療保障工作的通知》,裡面第三條指出:疫情期間,對新冠肺炎篩查對象在發熱門診發生的門診篩查費用(包括但不限於胸部CT、核酸檢測等),按規定全部臨時納入醫保基金支付范圍。另外,深圳對於一些在家自我隔離的人員,檢測病毒核酸也是免費的。

也就是說,在廣東省,疫情期間只要你是新冠肺炎篩查對象,在發熱門診做新冠肺炎核酸檢測、胸部CT篩查等,產生的費用都是零收費。

二、上面說了新冠肺炎核酸檢測費用,下面我們就來說一下做一次核酸檢測需要經歷哪些過程

本次的核酸檢測一般都是在檢驗科的分子生物遺傳室檢測,而作為檢驗科的一員,對於核酸檢測最熟悉不過了。除了前期的采樣不在檢驗科之外,其他的病毒滅活、核酸提取、基因擴增等都在實驗室里進行。下面我們就這幾個過程來簡單的介紹一下,我會盡量說的通俗易懂點,讓大家都比較容易理解。

●第一步:咽拭子采樣

本次的新冠肺炎核酸檢測,第一步就是對患者進行咽拭子采樣。這主要是疾控中心的人員或者發熱門診的工作人員進行采樣,只需要患者要將口罩摘下來,然後張嘴發出「啊」的聲音,使整個沿後壁暴露出來。之後采樣人員再將采樣棒伸到病人的咽後壁,塗擦取樣,最後將樣本放入試劑管里密封,這樣就完成采樣。

在采樣的時候患者會有一種嘔吐感,畢竟采樣都時候是在咽後壁,會產生一定的刺激。而且取完之後還會有一段時間有點異物感,畢竟采樣泵在咽後壁周圍來回塗擦,不過呢這些都是正常的。

采樣其實是非常重要的,這關乎到檢測結果的准確性,如果采樣不合格的話,沒有塗抹到病毒的話,那麼就會影響到結果的檢測。另外,采樣時也是比較危險的,畢竟在采樣時面對患者,如果是確診患者那麼就是直接面對病毒了。所以采樣人員斗是全部武裝,從頭到腳都要包得嚴嚴實實,就是做好防護。

當采樣完成之後,就有專門的人員通過樣本交接專用通道,將剛剛採集到的咽拭子標本與檢驗室的檢驗人員進行樣本交接。

●第二步:病毒滅活

(放入56℃的水浴箱30分鍾滅活)

當採集好的咽拭子標本送到檢驗科之後,檢驗科的工作人員就會對樣本進行滅活處理。

為什麼要進行病毒滅活處理呢?因為這是核酸提取的第一步。我們將樣本放入水浴箱內,進行一個56度30分鍾的殺毒操作。

為什麼要經過56度30分鍾的殺毒操作呢?這是因為病毒在經過56度30分鍾的水浴處理後,就可以將病毒滅活,可以在不影響檢測結果的情況下,確保檢測人員安全,這樣操作人員感染風險就會大大降低。

另外,當樣本經過30分鍾滅活之後,還需要常溫靜置20分鍾,這樣可以防止高溫開蓋從而導致的氣溶膠污染。

●第三步:核酸提取

經過病毒滅活之後就到核酸提取的步驟,這個操作是非常危險的,必須在生物安全櫃中進行操作,因為這是離病毒最近,也是感染風險最大的地方。在安全櫃內打開樣本蓋子提取核酸時,需要非常小心的打開蓋子,因為一不小心就可能形成氣溶膠,不僅會污染安全櫃,而且也可能讓其他樣本交叉感染,形成「假陽性」。

所謂的核酸提取就是將樣本中的病毒 RNA,也就是核酸,提取出來。但是因為 RNA 結構不穩定,需要先把它轉化成 DNA。這個過程就汲及到PCR反應,就是通過變性、退火、延伸等步驟,通過逆轉錄的過程,將RNA兩條鏈分開,使病毒信息傳遞到DNA 單鏈上,這樣就可以將病毒的核酸提取出來了。

●第四步:基因擴增

核酸提取出來後,數量是很少的,機器根本就探測不到。這個時候就需要以提取出來的病毒核酸作為模板,讓 DNA 不斷自我復制,而經過20~30次的復制後,模板DNA的含量就可以擴大到100萬倍以上。這樣經過擴增之後,如果存在有新型冠狀病毒核酸的話,那麼就可以檢測出來。就像我們微生物室檢查是否有細菌感染的時候,就需要將細菌進行培養,之後才能進行鑒定和葯敏試驗。這都是同一個道理,就是數目要足夠多才能檢測出來。

總的來說,整個核酸檢測的核心就是讓 DNA 不斷自我復制,並且積累熒光信號,這樣到最後才能被儀器檢測出來,從而進行判讀。

在理想情況下,病人樣本中如果有新冠病毒,循環數和熒光量之間就會形成 S 形曲線,即可判斷核酸檢測陽性。如果沒有或有少量新冠病毒,那麼就沒有類似曲線,即可判斷核酸檢測為陰性。

總之,實驗室的核酸檢測這一整個過程,從樣本滅活、核酸提取、基因擴增、結果分析,到最終出報告,大概要持續6個小時。如果檢測結果為「陽性」,還需要再做一次進行復核。所以說,一份新冠核酸陽性報告出爐,至少需要12小時。

三、題後話:

以上就是關於核酸檢測的費用以及做一次核酸檢測要經歷哪些過程的講解。通過我以上的講解,我相信大家都有了一個大致的了解。希望我的回答能讓大家滿意。

⑶ 深圳市第四人民醫院HIV檢測是用什麼方法它和疾病控制中心的檢測方法有區別嗎HIV窗口期是多久

醫院一般用快速法 疾病控制中心用酶聯法過了窗口期兩樣沒區別 窗口期有的說6周 3個月 6個月我本人認同6周論 6周檢查一次陰就可以放心 如果不放心就3個月復查現在沒有6周轉的請放心